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La prévalence est inconnue et l'incidence annuelle de la glycogénose par déficit en G6P est d'environ 1/100 000 naissances. Le type a, le plus fréquent, touche 80% des patients.

La maladie peut se manifester à la naissance par une hépatomégalie ou, plus souvent, vers trois à quatre mois par des symptômes d'hypoglycémie induite par le jeûne (tremblements, convulsions, cyanose, et apnées). Les signes, dus au trouble de l'homéostasie du glucose, se caractérisent en règle par une intolérance au jeûne, une hépatomégalie majeure (pouvant atteindre huit à dix cm sous le rebord costal droit), un retard de croissance (staturo-pondéral et pubertaire), généralement amélioré par un régime approprié, une ostéopénie et parfois une ostéoporose, un faciès poupin, une légère hypotonie, une néphromégalie et un trouble fonctionnel plaquettaire entrainant un épistaxis fréquent. Une diarrhée peut être observée. Les complications tardives sont hépatiques (adénomes et transformation rare mais possible en hépatocarcinome) et rénales (hyperfiltration glomérulaire à l'origine d'une protéinurie, voire d'une insuffisance rénale), mais elles comportent aussi une anémie parfois sévère et un risque de souffrance cérébrale liée à l'hypoglycémie. Une hypertension artérielle pulmonaire a été rapportée dans quelques cas.

La maladie est due à un dysfonctionnement du système de la G6P, étape clef de la régulation de la glycémie. Le type a est du à des mutations du gène G6PC (17q21) codant pour la sous-unité catalytique G6P-alpha à expression restreinte (foie, reins, intestins). Les nombreuses mutations soulignent l'hétérogénéité allélique de la maladie.

Sa transmission est autosomique récessive.

La prise en charge est identique dans les deux types, a et b, de la glycogénose par déficit en G6P (voir ce terme).